一、發(fā)酵飼料中可以使用的微生物菌種有哪些？  
乳酸菌 
腸球菌屬的糞腸球菌、屎腸球菌和乳酸腸球菌，乳桿菌屬的德式乳桿菌乳酸亞種、德氏乳桿菌保加利亞亞種、嗜酸乳桿菌、干酪乳桿菌、副干酪乳桿菌、植物乳桿菌、羅伊氏乳桿菌、纖維二糖乳桿菌、發(fā)酵乳桿菌和布氏乳桿菌，雙歧桿菌屬的兩歧雙歧桿菌、嬰兒雙歧桿菌、長雙歧桿菌、短雙歧桿菌、青春雙歧桿菌和動物雙歧桿菌，片球菌屬的乳酸片球菌、戊糖片球菌，鏈球菌屬的嗜熱鏈球菌。 
丙酸桿菌 
產(chǎn)丙酸丙酸桿菌。 
芽孢菌 
芽孢桿菌屬的地衣芽孢桿菌、枯草芽孢桿菌、遲緩芽孢桿菌、短小芽孢桿菌和凝結芽孢桿菌，短芽孢桿菌屬的側(cè)孢短芽孢桿菌，梭菌屬的丁酸梭菌。 
酵母菌 
產(chǎn)朊假絲酵母和釀酒酵母。 
霉菌 
黑曲霉和米曲霉。 
光合細菌 
沼澤紅假單胞菌。 
二、生物飼料發(fā)酵是否必須額外添加菌種？ 
就技術而言，飼料發(fā)酵不一定要額外添加菌種，因為很多飼料原料，特別是青綠飼料原料本身就含有較為豐富的乳酸菌、酵母菌等微生物，可以直接發(fā)酵。 
如果使用了大量谷物或副產(chǎn)品原料，并且為了滿足不同批次發(fā)酵飼料產(chǎn)品質(zhì)量穩(wěn)定均一的要求，現(xiàn)在發(fā)酵飼料生產(chǎn)實踐中一般都額外添加較大量的發(fā)酵菌劑，以保證產(chǎn)品的穩(wěn)定性。 
三、發(fā)酵菌種的選擇應注意哪些方面？ 
發(fā)酵菌種選擇首先應在農(nóng)業(yè)部(現(xiàn)農(nóng)業(yè)農(nóng)村部)公布的《飼料添加劑品種目錄》范圍內(nèi)。但作為發(fā)酵飼料用菌種的選擇，核心目的在于原料的預處理或發(fā)酵的代謝產(chǎn)物，不同于作為飼料添加劑中微生物的選擇。不同目的的發(fā)酵飼料選擇的菌種是不一樣的。另外，生物發(fā)酵飼料也并非是一定要使用常規(guī)的飼料原料或副產(chǎn)品原料。 
選擇菌種時應圍繞以下幾點：
1.用于處理原料中的抗營養(yǎng)因子，如豆粕中的大豆抗原、寡糖，菜粕中的硫苷、單寧，全脂米糠中的植酸磷等，應選擇分解相應抗營養(yǎng)因子能力強的菌株，當然一些酶制劑也有相應效果，主要看成本和價值。 
2.用于原料中纖維素、淀粉、蛋白質(zhì)的預消化，此時應選擇產(chǎn)纖維素酶、非淀粉多糖酶、淀粉酶、蛋白酶能力強的菌株。也可直接選擇相應的酶制劑，視綜合成本和價值而定。 
3.用于生產(chǎn)普通的初級代謝產(chǎn)物，如乳酸、丁酸、營養(yǎng)性小肽等，應選擇產(chǎn)酸能力強、產(chǎn)小肽含量高的菌株。 
4.用于產(chǎn)生功能性發(fā)酵代謝產(chǎn)物，如功能性小肽。應先明確目標功效成分是什么，再選擇相應菌株(一般需要特定發(fā)酵底物或誘導物)，也可使用部分定位水解酶。 
四、如何選擇飼料發(fā)酵的菌種種類？ 
目前常見的飼料發(fā)酵菌種主要包括三類:芽孢桿菌類、乳酸菌類和真菌類。 
發(fā)酵菌種的選擇根據(jù)發(fā)酵目的而定：對于降解原料中大分子蛋白或多糖等，可以選擇產(chǎn)酶能力較強的芽孢桿菌類或真菌類中的曲霉類；以生鮮原料保存為目的的飼料發(fā)酵可以選擇乳酸菌類；對于高糖原料的增值利用、生產(chǎn)菌體蛋白等可以選擇真菌中的酵母類進行發(fā)酵。